Форум » ГЕНЕТИКА И ПЛЕМЕННОЕ РАЗВЕДЕНИЕ » Записки коматозного генетика ;) » Ответить
Записки коматозного генетика ;)
Yvette: Идея давняя - ей лет 10-15. Хочется написать серию текстов в стиле "Генетика и молекулярная биология для чайников", но так как писать я могу только, когда моя генетическая муза глаза продирает, то не обещаю писть часто от себя. сечас есть повод начать. Во-первых, это к нашим черепашкам во вторых есть миленькая задача с другого форума, точнее две. Задача номера 1. от девушки поного "чайника " [quote]К слову сказать, мама моей пропавшей кошки была ( и есть) черепаха. Не знаю с каким там котярой она с"вязалась" на даче, но родились котята именно черепахи и красные, и одна-единственная, которую никто не захотел тогда брать - моя любимая чернючка! Хозяйка еще тогда очень удивлялась- ну в кого она одна такая уродилась... Ничего в этих породах и в разведении не понимаю! А можно спросить у профессионалов или кто знает- от каких кошек-сибирячек родятся черные котята?[/quote] Сначала предлагаю попытаться разобраться самим, напоминаю красный сцеплен с полом, генотипы XOXO - красная кошка XoXO - черепаховая кошка XoXo - не красная и не чрепаховая, а например черная, голубая и т.д. XOY - красный кот XoY - не красный кот Черная зверь B- Голубой зверь b Предлагаю вычислить окрас папика и теоретическое распределение по окрасам у котят.
Yvette: Я не умею хорошо объяснять математические понятия, поэтому, сегодня в основном буду цитировать великолепный и любимый мной учебник Аяла, Крайгер «Современная генетика». «Вероятность можно определить, как число благоприятных исходов какого-то события, деленной на общее число возможных исходов» Говоря языком уже расписанных нами схем - вероятность того, что растение, потомок от скрещивания двух гетерозигот окажется гетерозиготой равна 2/4 или ½. «Иногда вероятность того или иного исхода заранее не известна; тогда ее можно определить экспериментально, наблюдая, с какой частотой реализуется данный исход». Вероятность может принимать значение от 0 до 1 или от 0% до 100%. Отрицательные значения вероятность принимать не может (хотя, у некоторых исследователей случается, когда они вместо, того что бы немного серое вещество напрячь напрягают ПК).
Sally Morgan: Тут, по-моему, все довольно понятно...Дальше!
Yvette: Дальше надо картинку нарисовать - рисую Только я это рисовать разучилась - никакой фотошоп не поможет :( .. Когда беру свои рисунки, которые лет в 17 делала (да и в универе - год рисовала всяких тварей беспозвоночных - красиво ведь рисовала) - плакать хочется - куда все ушло ?
Sally Morgan: А ты просто на бумаге нарисуй да отсканируй эту бумагу.
Yvette: Дык, сканера нэт , в общем , завтра , а то меня сейчас ждут - долги подруга хочет раздать - надо с ее мальчиком посидеть, ну, и мне она кое что должна ...
Sally Morgan: Да я как раз про сканер на работе имела в виду.
Yvette: Sally Morgan пишет: Да я как раз про сканер на работе имела в виду У нас тут нет сканера - мы на выселках живем...
Sally Morgan: Да ладно, мы подождем хоть какого-то решения проблемы.
Yvette: Нарисовала страшную иллюстрацию, полдня ее боялась, но делать нечего (лучше вряд ли подучиться, надо было ее все же в розовый покрасить, хоть гламурненько было бы )… Закон сложения вероятностей. Вероятности взаимоисключающих друг друга событии просто складываются. Смотрим на страшную иллюстрацию – там типа А это ½ площади В и С по ¼. Если В+А, то получается ½+1/4 =3/4 (насколько помню в начальной школе нас дробями мучили). В наших терминах при скрещивании гетерозигот Аа вероятность возникновения трех генотипов составляют: ¼ гомозигот аа, ½ гетерозигот Аа и ¼ гомозигот АА. Следовательно, вероятность того, что в потомстве появится доминантный фенотип равна ½+1/4 =3/4 . Закон умножения вероятностей (этот закон нам понадобиться в ближащем будущем) . «Вероятность того, что несколько взаимно независимых исходов реализуются одновременно, равна произведению вероятностей каждого исхода». Пример взаимно независимые исходы я хочу на бытовом примере показать. Два вида пальто зимнее и осеннее – красного цвета. Зимнее и красного цвета это взаимно независимые исходы. Пример с тем же скрещиванием гетерозигот между собой. Какова вероятность того, что организм-потомок будет генотипа аа? Очень просто – вероятность того, что потомок получи аллель а от одного родителя равна 1/2 , и что от вторго тоже ½; ½*1/2=1/4.
Sally Morgan: Ясно. И зря ты на картинку ворчишь - намана все.
Yvette: Теперь собственно о том, почему я статистику и теорию, вероятности решила вспомнить. В биологии случай правит бал, не просто случай, а случай закономерный. А статистические закономерности проявляются только при достаточно большой выборке.. «Выборка (цитирую с сайта ВЦИОМ- они точно знают про статистику все) – представительная часть генеральной совокупности (т.е. всех объектов исследования), в которой интересующий нас признак распределяется по тому же закону, что и в самой генеральной совокупности. Можно также сказать, что выборка – это тот способ, с помощью которого формируется группа непосредственных объектов исследования. В то же время, выборка должна репрезентировать (представлять) не все на свете, а только объект исследования. Процесс (вид выборки) должен позволять лучшим образом репрезентировать объект исследования (генеральную совокупность). Существует несколько основных видов выборки: • Случайная выборка - способ отбора, при котором каждый элемент генеральной совокупности имеет одинаковую вероятность быть выбранным. Реализовать случайную выборку можно, используя такие приемы, как лотерейный метод и/или таблицу случайных чисел. С помощью этого типа выборки проводится большинство телефонных опросов и опросов по каким-либо спискам (например, избирательным). Для построения случайной выборки необходим список всех элементов генеральной совокупности. • Систематическая выборка - процедура отбора каждого n-го элемента из списка элементов генеральной совокупности. По этому принципу формируются разного рода адресные выборки, например – квартирные, когда квартиры для проведения анкетирования/интервьюирования отбираются по определенной схеме (первая от лифта, первая слева, и т.д.) • Квотная выборка формируется на основе определенных параметров (квот) – например, социально-демографических характеристиках индивидов. Этот тип выборки применяется, как правило, в случае небольшой генеральной совокупности. Важной особенностью является то, что для квотной выборки не вычисляется ошибка. • Спонтанная выборка – этот тип выборки, респонденты для которой отбираются случайным образом или с определенным шагом, например – в местах массовых скоплений. Как правило, используется при уличных опросах в местах массового скопления людей (у метро, культурных памятников, развлекательных центров, и т.д.). Важным понятием, связанным с применением количественных методик, является ошибка выборки. Ошибка может быть систематической – тогда, когда она заложена в саму процедуру отбора респондентов, и случайной, которая неизбежно возникает в силу того обстоятельства, что опрошена не вся генеральная совокупность, однако всегда может быть рассчитана и представлена. Пояснения. Итак, составляя выборку по признакам, мы может взять только растения одного вида (это однородность выборки), а то ведь Мендель мог взять и горох смешать с бобами или фасолью. При этом нам совсем не надо брать весь горох не свете (да и даже не весь горох с огорода), достаточно взять только горох с опытных грядок. В биологии в той или иной степени используют все четыре вида выборки, но чаще первые три. Про ошибки выборки надо помнить всегда, для нивелирования этих ошибок используют контрольные эксперименты. От цитату выделила , а то правда, пояснения потерялись...
Sally Morgan: Лена, а ты применительно к нашим баранам...эээ...к кошкам это переведи, а то, имхо, не всяк поймет.
Yvette: Про кошеек пример придумала, сейчас запишу, к вечеру выложу .. Пример ИМХО - мм - пальчики оближешь - весь вечер приумывала - утром решение появилось
Sally Morgan: Ждем-с...
Yvette: Начну издалека. Кошки – многоплодные животные. Считается, что 2 котенка это - очень маленький помет. И например, ветеринар ( которую в нашем клубе рекомендуют), считает, что если кошка родила одного - двух котят, то к следующей вязке-беременности ее надо готовить особо, стимулировать различными поддерживающими препаратами. Итак, вы решили проверить, «а не зажимает ли моя краса котят?». Как это можно сделать? Например, можно сравнить с другими кошками. Вот как раз тут нам понадобиться умение правильно сделать выборку. Что важно для нашей кошки. Безусловно, надо сравнивать с другими домашними кошками (негибридами с другими видами), а то для львов один – два – это норма. Если кошка породистая, то имеет смысл сравнивать с представителями породы. А если она из какой-нибудь известно линии, то лучше сравнивать ее с кошками этой линии. В отдельную выборку стоит взять мать, сестер матери, можно бабку по матери и сестер самой кошки. Но как собственно сравнивать и массив выборки мы обсудим позже. Я на всякий случай прошу запомнить это пример и когда мы дойдем до всяких хи квадрато, дисперсий и распределений напомнить мне. У меня даже есть конкретные цифры по трем кискам ;) , в качестве контроля возьмем парочку пометов из «рекламы питомников»
Sally Morgan: ОК.
Касандра: Лена, классная тема! Буду тоже изучать. Надеюсь, что с хи-квадратами, дисперсиями и т.д. мне будет полегче, чем с генетикой, все-таки мехмат Лен есть вопрос на счет примерчика с длиной шерсти. Если рассматривать Касю, у нее шерсть немного длинновата, это можно отнести к генотипу ll? Или тут все сложнее гораздо и в рамки задачки не входит, надо все глубже рассматривать? А то я попыталась составить что у нас с котятами от Локена должно было получиться и что получилось, как то не сходится...
Sally Morgan: Касандра Присоединяйся к нам! Не только в этой теме.
Касандра: Sally Morgan, пыталась сегодня представить своих котеек, но темку почему-то закрыли. А еще я не разобралась, как фотографии прикреплять, подскажите, пожалуйста.
Yvette: Хм, а куда мой пост делся ? С фоточкой Катя, темку надо новую открыть - она просто стала большой.
полная версия страницы